Quando aplicado na análise de acervos escavados em sequência estratigráfica, fica claro o conceito de fases, pois corresponde à sequência cronológica das ocupações. Onde se pode usar os critérios de decoração e anti-plástico para estabelecer as fases nas diferentes ocupações. O problema consiste no uso do termo fase, para as coleções cerâmicas encontradas em ocorrências de superfície. Nesse caso, o conceito de fase está atrelado à noção de tecnologia. E como não é possível datar os objetos, pode-se gerar fases fictícias descontinuas, que não expliquem as culturas arqueológicas e os motivos das mudanças dos objetos.

O problema do uso da variável fase, centra-se na produção de múltiplas fases cerâmicas. Desconsideram-se os contextos dos sítios, para focar apenas no estabelecimento das mudanças tecnológicas entre as fases. Garantindo assim, cronologias absolutas.

O problema do uso da variável fase é devido ao fato de provocar uma abordagem analítica de alto desempenho. A noção de fase está incluída nas metodologias criadas pelo PRONAPA, para poder correlacionar as culturas arqueológicas com as culturas ceramistas dos grupos indígenas da Amazônia.

As inconsistências do uso do termo fase são devidas ao fato de que as seriações efetuadas não conseguem estabelecer qualquer sequência evolutiva ou curvas de frequências.

O acesso aos métodos de datação descartou o uso da variável fase. Pois as datações absolutas permitiram estabelecer as reais sequências dos objetos, independentemente dos estratos arqueológicos onde foram encontradas.