Em microscopia óptica de rotina, na microtomia de blocos, a espessura das peças para análise é adequada entre 4 e 8 micrômetros.

Se for realizada a inclusão em parafina, o revestimento da porção interna da vidraria com papel de filtro é um procedimento que facilita o processo, uma vez que evita a forte interação da parafina com o vidro e a alteração do resultado.

Como dispensa a desidratação, a inclusão em glicol metacrilato é mais rápida, apesar de menos utilizada que a inclusão em parafina, por ser mais cara.

A imagem abaixo mostra um processador automático de tecidos em que o material fixado e corado deve ser inserido para que a inclusão e a microtomia sejam realizadas automaticamente.

O clareamento pode ser feito com xileno, tolueno, clorofórmio ou salicilato de metila.

Em laboratório, a seqüência mais adequada para o tratamento de materiais de rotina para análise histológica é: fixação, inclusão, clareamento, desidratação e microtomia.

A fixação por congelamento é um método que facilita a visua lização de contrastes na coloração por hematoxilina/eosina.

A fixação com formaldeído (cuja estrutura está representada abaixo) deve, na maioria das situações, ser realizada em uma solução tamponada, osmoticamente balanceada e aplicada por meio de perfusão ou imersão.

Aumento no espaço intercelular pode ser conseqüência de artefato de fixação.