Cistos do ducto tireoglosso apresentam-se tipicamente como massas laterais ao longo do bordo anterior do músculo esternocleidomastoideo.

Anomalias do segundo arco branquial são as mais comuns entre as malformações congênitas cervicais e costumam localizar-se lateralmente no pescoço.

Cistos dermoides cervicais raramente simulam cistos do ducto tireoglosso, pois não apresentam mobilidade à deglutição nem se apresentam na linha média.

Fístulas do terceiro e quarto arcos branquiais localizam-se preferencialmente na linha média cervical.

A presença de drenagem cutânea exclui a possibilidade de origem branquial da lesão.