Uma doença típica do porquinho da índia é a leishmaniose tegumentar, causada pela Leishmania enrietti, que tem potencial zoonótico e tem sido confundida com neoplasias. Os animais afetados apresentam lesões nodulares nas extremidades corporais, principalmente em orelhas, dígitos, extremidade do nariz e raramente pálpebras.

Os roedores miomorfos e sciuromorfos têm raízes verdadeiras nos dentes pré-molares e molares (dentes radiculares), os quais são classificados como anelodontes braquiodontes (dentes com crescimento limitado e comprimento da coroa menor que o da raiz, semelhantes aos dentes dos primatas). Já os roedores caviomorfos e os lagomorfos têm todos os dentes elodontes (inclusive pré-molares e molares) com crescimento e erupção constante.

O suporte nutricional deve ser considerado em qualquer animal que não estiver se alimentando. Animais anoréxicos podem apresentar alteração significativa na microbiota gastrintestinal após 48 horas. Essa modificação pode levar a hipermotilidade intestinal, supercrescimento de bactérias patogênicas e enterotoxemia. A presença de água no meio ambiente intestinal favorece o desequilíbrio dos microrganismos encontrados no ceco, consequentemente levando à produção de gases e toxinas pelos microrganismos ou à morte dos microrganismos desejáveis

As doenças respiratórias são mais raras em roedores de estimação. Algumas bactérias como Streptococcus spp., Mycoplasma, Pseudomonas e Pasteurella normalmente não estão presentes na microbiota respiratória e, quando entram nas vias respiratórias, podem gerar a doença clínica independente de fatores predisponentes.