A cada quatro anos, o Banco Nacional de Perfis Genéticos e os laboratórios participantes da Rede deverão ser auditados para averiguação de conformidade.

A equipe auditora deve ser constituída por profissional com experiência prévia de, no mínimo, dois anos, em biologia molecular ou celular, preferencialmente aplicada à identificação humana.

O laboratório ou o Banco Nacional de Perfis Genéticos deve enviar a documentação solicitada com, pelo menos, sete dias de antecedência à auditoria.

O prazo para regularização das não conformidades, dependendo da complexidade de sua resolução e do potencial impacto na qualidade dos resultados, será fixado entre quinze e trinta dias.

O processo de auditoria inicia-se com a notificação da gerência do laboratório a ser auditado ou do Banco Nacional de Perfis Genéticos, com antecedência mínima de noventa dias da data em que ocorrerá a averiguação.