A amostra de fezes para análise parasitológica não necessita ser colhida pela manhã, mas não deve conter resíduos de papel higiênico, ou urina que podem prejudicar o exame.

A análise de fezes no exame parasitológico não requer jejum do paciente, nem restrição de alimentação e, na maioria das vezes, podem ser recebidas frescas, ou conservadas mediante refrigeração ou com conservantes, como por exemplo, a solução de formaldeído a 10%.

Para as amostras diarreicas e liquefeitas, é obrigatório que o exame seja realizado em 30 minutos após a coleta, para melhor identificação de trofozoítas. O cliente deve ser orientado a colher a amostra e encaminhá-la imediatamente ao laboratório.

A análise parasitológica das fezes envolve não apenas a análise microscópica, mas também a pesquisa macroscópica, na qual podem ser visualizados proglotes de cestódeos, formas adultas de Enterobius vermicularis, muco, sangue, oocistos de parasitas, dentre outros achados que permitem um diagnóstico laboratorial de mais qualidade.

As amostras de fezes devem estar isentas de água e urina para que não ocorra interferência no resultado, como degeneração, lise de parasitas, principalmente trofozoitas, ou contaminação.