A Secretaria de Vigilância em Saúde trabalha para a promoção e disseminação do uso da metodologia epidemiológica em todos os níveis do SUS. Entre seus objetivos, citam-se o monitoramento do quadro sanitário do país, a implementação e avaliação das ações de prevenção e controle de doenças e a organização dos serviços e ações de saúde.