Os medicamentos sujeitos a controle especial (Portaria SVS nº 344/1998) não precisam ser armazenados isolados dos demais, nem sob controle do farmacêutico.

Os medicamentos devem ser armazenados de acordo com as especificações do fabricante. Na ausência de recomendação específica, estoque em temperatura ambiente (15-20°C).

As insulinas NPH e Regular devem ser mantidas dentro da embalagem original entre 2 e 18°C.

Os medicamentos armazenados sobre estrados (paletes) devem estar a uma distância mínima de 20 cm da parede e 30 cm do telhado.

Alguns medicamentos exigem cuidados especiais de armazenamento, como termolábeis e psicotrópicos.