Agrobacterium radiobacter, Athelia bombacina, Bacillus subtilis e Pseudomonas fluorescens são exemplos de bactérias usadas no controle biológico de plantas.

Segundo a Teoria da Trofobiose de Francis Chaboussou, a adubação mineral e o uso de agrotóxicos provocam o acúmulo de nitrogênio e aminoácidos livres no suco celular e na seiva da planta, favorecendo os patógenos.

Para aumentar a eficiência da solarização de solos, recomenda-se cobrir o solo com filmes plásticos de coloração preta por períodos mais longos de tempo.

O leite cru diluído é recomendado para controlar os míldios em diferentes culturas, tais como abóbora e cebola.

As interações entre microrganismos patogênicos e seus agentes de controle biológico podem ser classificadas em antibiose, parasitismo e simbiose.