Os genótipos 1 e 2 infectam somente humanos, com via de transmissão fecal-oral e predomínio na África, Ásia e México, enquanto os genótipos 3 e 4 são considerados zoonoses, tendo o porco como hospedeiro primário e contágio humano pelo consumo de carne contaminada, afetando os países desenvolvidos.

Todo paciente com hepatite aguda deve ser testado para hepatite E, com realização de exame sorológico (anti-HEV IgM) e pesquisa do DNA do virus (HEV-DNA).

Tem elevada taxa de mortalidade em gestantes.

Pacientes imunossuprimidos podem desenvolver infecção crônica pelo vírus da hepatite E.

Pode causar manifestações extra-hepáticas neurológicas, como síndrome de Guillain-Barré, amiotrofia neurálgica, encefalite ou mielite, bem como glomérulo-nefrite e trombocitopenia.