Para a preparação de amostras tanto para microscopia de fluorescência como para confocal, alguns protocolos utilizam rotineiramente algum fluoróforo, como a fluoresceína, ligada a um anticorpo para reconhecer especificamente uma proteína. Esse tipo de técnica permite a localização precisa de uma determinada proteína dentro da célula. O pesquisador pede ajuda ao tecnólogo para realizar a técnica em que ele consiga marcar duas proteínas diferentes na mesma célula e localizar suas posições. O tecnólogo utilizará a técnica de: