O tratamento indireto aborda as capacidades que são pré-requisitos ou a capacidade de engolir, sem a ingestão de alimento ou líquido, como é o caso de pacientes que estão em alto risco de aspiração em geral.

O tratamento indireto reabilita as capacidades que são pré-requisito ou a capacidade de deglutição durante pequenos lanches terapêuticos ou refeições e engloba exercícios ou manobras compensatórias.

O tratamento indireto envolve a manipulação do ambiente e exercícios de amplitude de movimento, fortalecimento, coordenação para a musculatura oral e faríngea enfraquecida ou hipotônica, entre outros.

A otimização das habilidades de autoalimentação é uma importante meta a ser abordada em conjunto com as metas de deglutição, tanto no tratamento direto quanto no indireto, como os padrões motores utilizados relacionados àqueles usados no segmento voluntário da deglutição.