Seu principal objetivo é contribuir no processo de cuidado à saúde, visando melhorar a qualidade da assistência prestada ao paciente.

A Farmácia Hospitalar é uma unidade clínica, administrativa e econômica, dirigida por farmacêutico, sem vínculo hierárquico com a direção do hospital sendo, portanto, considerada uma unidade independente.

No campo de atuação clínica, o foco da Farmácia Hospitalar e de serviços de saúde deve estar no paciente e no atendimento de suas necessidades.

O desenvolvimento das ações da Farmácia Hospitalar vai além dos planos assistencial, econômico, de pesquisa e de ensino.

A atuação da Farmácia Hospitalar deverá ser pautada em conceitos da economia da saúde, modernas técnicas de controle de custos buscando o desenvolvimento de ações economicamente viáveis e soluções sustentáveis para a instituição hospitalar.