A monitorização mais confiável para esterilização em autoclave é a biológica, pois é feita com microrganismos tecnicamente preparados e indicadores biológicos, para demonstrar a esterilização.

O monitoramento biológico deve ser registrado, juntamente com a data da esterilização, lote, validade e equipamento utilizado.

Monitoramento Físico: consiste na observação e registro dos dados colhidos nos mostradores dos equipamentos, como a leitura da temperatura, da pressão e do tempo em todos os ciclos de esterilização.

Monitoramento biológico: o monitoramento biológico é realizado utilizando-se tiras de papel impregnadas por esporos bacterianos do gênero Bacillus, de bactérias termofílicas formadoras de esporos, capazes de crescer em temperaturas nas quais as proteínas são desnaturadas.

O método de monitoramento físico mais utilizado é o teste Bowie-Dick, de parâmetro simples, multiparamétrico, integrador e emuladores.