Com a coprocultura de rotina, é possível identificar todos os patógenos entéricos que causam quadros de diarreia.

Para a maioria das bactérias que causam diarreia, a fonte de infecção são alimentos e água contaminada, exceto Clostridium difficile, que acontece a partir do contato pessoa a pessoa, ambiente contaminado e uso prévio de antimicrobianos.

O caldo de enriquecimento, por exemplo, caldo selenito, serve para favorecer o desenvolvimento dos microrganismos da microbiota intestinal habitual das fezes.

A coleta das fezes deve ser realizada após 48 horas do primeiro episódio de diarreia, uma vez que a positividade da cultura aumenta com o tempo.

Para a pesquisa de agente etiológico causador de gastroenterite, as amostras de fezes bem formadas são recomendadas para o exame de cultura de fezes, exceto para a cultura e pesquisa de portadores de Salmonella spp.