O enterovírus Encephalitozoon cuniculi, uma vez identificado no líquor de camundongos e ratos de laboratório, causa uma doença semelhante à encefalomielite infantil humana.

O vírus da encefalomielite de Theiler causa neoplasias hematopoiéticas sob condições apropriadas e é muito utilizado como modelo experimental para estudos de biologia molecular, virologia, genética, patologia e quimioterapia experimental de leucemias.

Leptospira interrogans Ballum é um agente que tem pouco significado como causador de infecções naturais, tendo baixa prevalência nas colônias atuais de camundongos.

Os testes sorológicos para detecção de anticorpos devem ser realizados em animais adultos de forma a selecionar apenas os animais com sinais clínicos de infecção.

A ectromélia é considerada uma virose periférica em camundongos, pouco se sabendo sobre sua ocorrência, presumindose, porém, que, quando transmitida como vírus latente, ela é capaz de alterar resultados experimentais.