A Babesia bovis é inoculada no bovino por larvas do carrapato a partir do primeiro dia de parasitismo já a Babesia bigemina somente começa a ser inoculada pelo estágio ninfal, ou seja, cerca de oito dias após a fixação das larvas.

O período de incubação da Babesia spp. varia de 10 a 20 dias, enquanto que o de Anaplasma marginale geralmente é superior a 20 dias.

O carrapato, Boophilus microplus, durante o repasto sanguíneo, inocula no hospedeiro os trofozoítos, estas formas penetram nos eritrócitos, se diferenciam em esporozoítos e multiplicam-se dando origem aos merozoítos. Estes rompem as hemácias e invadem novos eritrócitos, continuando o processo de divisão do tipo merogônica.

Os carrapatos se infectam com Babesia bigemina em todos os períodos de sua vida, contudo a infecção mais intensa ocorre nas últimas 48 horas de repasto sanguíneo quando sua tolerância à babesia tende a diminuir.

Considera-se que a transmissão biológica da anaplasmose, feita por carrapatos, é tão eficiente quanto a transmissão mecânica feita pela mosca de estábulo. Entretanto, os carrapatos machos são considerados mais importantes na transmissão da anaplasmose que as fêmeas.