O TRM-TB está indicado, prioritariamente, para o diagnóstico de tuberculose pulmonar e laríngea em adultos e adolescentes.

O TRM-TB está indicado para o diagnóstico nos casos de retratamento.

O TRM-TB não está indicado para diagnóstico de TB extrapulmonar.

O TRM-TB está indicado para triagem de resistência à etambutol nos casos de retratamento.

O TRM-TB não deve ser realizado em crianças menores de 12 anos de idade.