O principal fator de risco para a progressão da doença hepática no paciente com o VHC é a idade de aquisição do vírus: mais de 60% dos infectados com menos de 40 anos irão evoluir para cirrose no prazo de 20 anos comparado com 10% ou menos dos infectados com mais de 50 anos.

O período de incubação depois de uma exposição ao VHC é tipicamente de 2 a 12 semanas, período no qual o RNA do VHC é detectável e transmissível, porém as enzimas hepáticas permanecem dentro da normalidade.

Durante o primeiro ano de infecção, o RNA do VHC pode flutuar entre detectável e não detectável, tornando importante a repetição do exame em caso de não detectável para a confirmação da ausência de viremia.

Durante a infecção crônica, as transaminases estão elevadas de forma persistente ou intermitente, porém podem ser normais em até 20% dos pacientes.

A cura espontânea após a infecção aguda ocorre em 15 a 45% dos pacientes, e geralmente ocorre 6 a 12 meses após a infecção inicial.