Escolher o método analítico adequado ao que se pretende analisar, levando-se em consideração a quantidade do componente a ser analisado, a exatidão requerida, a composição química da amostra e os recursos disponíveis.

Como os alimentos são amostras sempre homogêneas, o processo analítico é geralmente simples sendo desnecessárias as operações como extração ou separação prévia antes de o componente ser analisado.

As amostras devem ser colhidas em qualquer parte do lote do alimento em quantidade de até 5% para qualquer tipo de amostra, desde que acondicionadas adequadamente e transportadas sob congelamento.

Após a coleta da amostra bruta, todo seu conteúdo deve ser analisado em laboratório para maior confiabilidade dos resultados, independentemente da quantidade de analito a ser analisado.