A coleta do teste antes de 48 horas de vida pode ocasionar em resultado falso positivo para hipotireoidismo congênito e falso negativo para fenilcetonúria.

A idade ideal da coleta é entre o 5º e o 7º dia de vida, devendo ser repetida se o recém-nascido prematuro com 30 dias de vida.

Recém-nascidos prematuros devem ter a coleta de sangue realizada somente quando completarem 40 semanas de idade gestacional corrigida.

O Programa Nacional de Triagem Neonatal preconiza que é obrigatória a pesquisa de fenilcetonúria, hipotireoidismo congênito e hemoglobinopatias; a pesquisa de outras doenças fica a critério do serviço de referência em triagem neonatal de cada estado.

A maior parte das crianças com hipotireoidismo congênito diagnosticada pela triagem neonatal não tem manifestações clínicas e por isso o tratamento pode ser postergado até um mês de vida.