Com exceção da glicina, os aminoácidos encontrados nas proteínas humanas são sempre isômeros D.

Os aminoácidos que compõem as proteínas são assim denominados por que contém, no mínimo, um grupo carboxila (-COOH) e um grupo amino (–NH2) ligados ao mesmo átomo de carbono alfa.

Para a formação da ligação peptídica entre dois aminoácidos que compõem a mesma proteína, deve ocorrer a reação entre o nitrogênio do grupo amino de um aminoácido e o carbono do carboxila do outro, com a liberação de uma molécula de hidrogênio (H₂).

A estrutura terciária de uma proteína corresponde ao dobramento localizado e repetitivo da cadeia polipeptídica em decorrência das pontes de hidrogênio que se estabelecem entre os átomos de oxigênio ou nitrogênio. Podem ser do tipo hélice ou pregueada.

A estrutura quaternária de uma proteína corresponde à forma tridimensional da cadeia polipeptídica, em decorrência de várias interações diferentes das cadeias laterais dos aminoácidos nela presentes. Essas ligações podem ser iônicas, pontes de hidrogênio, interação hidrofóbica ou pontes dissulfeto.