Para proteger-se da exposição a doenças infecciosas, um técnico de manutenção do departamento de engenharia clínica deve estar familiarizado com práticas básicas de controle de infecção e com procedimentos de pré-manuseio de equipamentos para reparação, como desinfecção, esterilização e descontaminação. A descontaminação é o processo de matar todos os agentes patogênicos reconhecidos; a desinfeção reduz os microrganismos para níveis seguros; e a esterilização mata todos os microrganismos.