De acordo com a espécie de animal de laboratório, a observação de sinais clínicos sugestivos para pneumonias, bronquites, alteração da capacidade respiratória, espirros, tosse e corrimento nasal podem ser indicativos para infecção por microrganismos como Mycoplasma pulmonis, Streptococcus pneumoniae, Bordetella sp. e Pasteurella sp.

As diferentes espécies de animais utilizados em trabalhos experimentais apresentam comportamento social pouco definido, o que dificulta o reconhecimento de animais-problema na colônia.

Os métodos clínicos usuais para avaliar as condições de saúde de um animal, ou de um grupo de animais de um biotério, se resumem em inspeção, palpação e auscultação, sendo a inspeção o método mais utilizado nas rotinas diárias do biotério.

A exteriorização da saúde do animal é observada pelo comportamento dos indivíduos da colônia, estejam eles isolados ou em grupos.

A densidade populacional elevada, a baixa frequência da troca de caixas e o tipo das caixas/gaiolas podem aumentar a umidade e a temperatura do microambiente dos animais.