O desenho do sistema de distribuição deve levar em conta a recirculação constante da água purificada e a manutenção da temperatura da água contida no tanque.

Tubulações, válvulas, instrumentos e outros dispositivos devem ter construção e acabamento sanitário, de forma a não contribuírem para que ocorra a contaminação microbiana e ser sanitizados.

Filtros de retenção microbiológica devem ser utilizados na saída, ou no retorno dos sistemas de distribuição de água para uso farmacêutico.

Os pontos de uso devem ser projetados de forma a evitar volumes mortos e possibilitar que a água recircule totalmente neles quando estiverem fechados.