Ao realizar um experimento de STEM-EDS para obtenção de mapas químicos, uma determinada área da amostra é dividida em píxeis nas direções x e y. Para cada píxel, adquire-se um espectro completo de EDS. Os dados podem ser, então, manipulados e analisados posteriormente, sendo possível fazer diferentes mapas com a utilização de janelas específicas de energia. O nome usual para esse modo de armazenamento de dados é: