A maior contribuição da epidemiologia para os municípios, no contexto das políticas de descentralização, é o suporte teórico à formulação dos programas de saúde, em particular para a formação dos profissionais e gestores.

A maior dificuldade no uso adequado da epidemiologia nos serviços de saúde é a escassez de informações demográficas e de morbi-mortalidade para o planejamento de ações coletivas

O uso da epidemiologia no cotidiano dos serviços é limitado por problemas de conflito teórico entre a dimensão coletiva de saúde, que é o foco dessa área de conhecimento, e o volume de demandas individuais, que sobrecarrega os serviços.

O uso da epidemiologia no cotidiano dos serviços de saúde é limitado por problemas de natureza conceitual, uma vez que a epidemiologia tem forte sustentação científica, e os processos de trabalho no cotidiano dos serviços têm baixa capacidade de absorver e produzir conhecimentos.

O uso da epidemiologia contribui com a missão dos serviços no contexto SUS por meio de produção de conhecimentos e do desenvolvimento de ações no coletivo, voltados à identificação e intervenção sobre os problemas que dificultam a melhora da situação de saúde de indivíduos e coletividades.