a fixação do nitrogênio atmosférico ocorre por meio dos organismos simbióticos fixadores de nitrogênio, de vida livre.

o nitrogênio fixado na forma de nitrato dissolve-se na água e no solo e é aproveitado pelas plantas, onde se transforma em nitrogênio orgânico, ligado a grandes moléculas.

quando o nitrogênio orgânico assimilado pelas plantas entra na cadeia alimentar, passa a constituir moléculas orgânicas dos organismos consumidores.

atuando sobre os produtos de eliminação dos organismos consumidores vivos e sobre os cadáveres dos organismos mortos, as bactérias mineralizam o nitrogênio na degradação da matéria orgânica, produzindo gás amônia (NH3) e sais de amônio (NH+ 4).

o gás amônia (NH3) e sais de amônio (NH+ 4) formados na reação de amonificação são convertidos diretamente a gás nitrogênio (N2) pela ação exclusiva de bactérias do gênero Pseudomonas, em um processo conhecido como nitrificação.