A levotiroxina sódica é a medicação de escolha para o tratamento do quadro.

O objetivo do tratamento deve ser manter a tireotrofina (TSH) sérica abaixo dos valores de normalidade (supressa), particularmente em mulheres no período pós-menopausa.

O tratamento combinado utilizando triiodotironina e levotiroxina, na proporção 3 para um, melhora substancialmente a qualidade de vida, a função cognitiva e o perfil lipídico, devendo se constituir na primeira opção terapêutica do quadro.

Nos casos onde haja concomitância com insuficiência adrenal primária, o tratamento com hormônio tireoidiano deve ser iniciado dois meses antes do início da reposição com glicocorticoide.