Microisoladores correspondem a gaiolas equipadas com filtros e, normalmente, são utilizados para alojar camundongos imunodeficientes ou, ainda, quando é necessário impedir que agentes patogênicos possam disseminar no recinto secundário.

Para animais convencionais, o uso de gaiola com fundo sólido e cama está recomendado.

As gaiolas pequenas (30 x 20 x 13 cm) podem alojar até dez camundongos com 25 gramas de peso vivo ou cinco hamsters jovens (até 60 gramas).

Em respeito às recomendações de espaço mínimo, gaiolas grandes quadradas (41 x 34 x 16 cm) podem alojar até oito ratos jovens (peso corporal até 100 gramas).