Em pacientes com pancreatite aguda a dieta enteral se torna inviável devido ao risco de reagudização da pancreatite, sendo optado pela dieta parenteral prolongada nestes casos.

Dietas sem proteínas devem ser instituídas em pacientes hepatopatas devido ao risco de encefalopatia hepática.

A ocorrência de déficit nutricional é maior no bypass gástrico quando comparado às técnicas restritivas, sendo frequente a necessidade de uso de suplementos nutricionais.

A deficiência nutricional em pacientes com doença inflamatória intestinal ocorre exclusivamente pelas perdas intestinais de eletrólitos, sangue e proteínas.

A terapia nutricional em pacientes com câncer não é indicada no pré-operatório, pois além de retardar o tratamento cirúrgico, os nutrientes ofertados seriam utilizados para o crescimento tumoral e formação de metástase.