A manipulação da cavidade abdominal leva a aumento dos volumes e capacidades pulmonares, resultando em hipoxemia e atelectasia.

Dentre as dificuldades com que o fisioterapeuta irá se deparar no tratamento dos pacientes de esofagectomia estão a incisão cirúrgica em duas cavidades do corpo, comprometimento da inervação brônquica e circulação linfática, disfunção pós-operatória dos músculos da respiração, reconstrução do órgão no espaço subesternal, caquexia e disfagia.

Esses pacientes apresentam clearance mucociliar prejudicado e diminuição da efetividade da tosse, e principalmente após a extubação devem ser realizadas aspirações de rotina para evitar acúmulos de secreção e aumento da taxa de infecção.

A ventilação não invasiva deve ser encorajada em todos os pacientes de pós-operatório de esofagectomia devido ao risco de atelectasias e de retenção de secreção.