O solo do município é formado basicamente por areia monazítica, depositada pelos rios originários predominantemente do Planalto Paulista, o que confere grande estabilidade ao terreno.

O município de Bertioga é cortado por diversos canais sinuosos de água salobra, influenciados pela maré, colaborando para o desenvolvimento dos mangues, cujo solo é rico em matéria orgânica.

O relevo predominante do município de Bertioga e o complexo de mangues, com forte sedimentação arenosa e pobre em matéria orgânica.

O município de Bertioga é composto exclusivamente por praias e, portanto, oferece baixas condições para construção civil.