Cristais de tirosina podem ser observados, principalmente, em urina de idosos (tirosinúria).

Cristais de oxalato de cálcio são normais e decorrentes da ingestão de algumas verduras ou frutas na alimentação.

Cristais de magnésio-amônio-fosfato consistem em uma das principais causas de urolitíase, pois estes cristais formam cálculos por meio de complexo de minerais.

Cristais de cistina podem estar relacionados com a doença hereditária do transporte renal de aminoácidos, caracterizada pelo aumento da excreção urinária de cistina e de aminoácidos básicos.