as moléculas de DNA são carregadas positivamente e migram do ânodo para o cátodo na corrida eletroforética.

a velocidade de migração é diretamente proporcional ao peso molecular do analito.

o gel de agarose, muito utilizado em eletroforese realizado em placa, forma pequenos poros, sendo o gel mais adequado à análise de proteínas, não sendo muito utilizado para ácidos nucléicos.

a eletroforese capilar é um aprimoramento da técnica de eletroforese, possuindo alta resolução e alta velocidade, sendo aplicado um campo elétrico mais elevado, reduzindo o tempo de migração dos fragmentos.

a eletroforese em placa é mais adequada para a análise dos STR's (short tandem repeat), que são regiões pequenas de repetição conhecidas como microssatélites.