O genoma humano é mais ou menos o mesmo em todas as pessoas, os mesmos genes estarão na mesma ordem com as mesmas regiões intergênicas os separando. Mas o genoma humano, bem como o dos demais organismos, contêm muitos polimorfismos, posições em que a seqüência de nucleotídeos não é a mesma em cada membro da população. Dentre os marcadores moleculares conhecidos, os a seguir incluem-se como os mais importantes para identificação de indivíduos (genetic fingerprinting), EXCETO: