Os métodos tradicionais para detecção de cistos de Giardia lamblia envolvem procedimentos para concentração e posterior visualização dos cistos por microscopia convencional, sendo, portanto, muito demorados. O uso de citometria de fluxo para essa finalidade é mais eficiente e rápido. Para isso, é feita a marcação das amostras com anticorpo monoclonal específico para o parasito e é utilizado Iodeto de Propídeo (PI). Esse teste possibilita a detecção do cisto do parasito nas amostras, como também a detecção da viabilidade das amostras, conforme ilustração a seguir.

A detecção pode ser realizada a partir de uma marcação com anticorpos monoclonais para moléculas de superfície desse parasito, e a avaliação da viabilidade, pode ser realizada com o marcador de morte celular representado por PI.
Os termos destacados estão indicados, respectivamente, pelos números da ilustração: