As encefalites virais geralmente ocorrem após a disseminação viral hematogênica no sistema nervoso central, mas herpes vírus e Lyssavirus podem causar doença neurológica através da disseminação por via nervosa.

Os agentes de encefalite viral mais comuns são o herpes vírus 1 e 2 e o enterovírus não pólio.

Se o paciente apresentar cefaleia, vômitos e papiledema, a tomografia computadorizada cerebral é recomendada antes da punção lombar para análise do LCR.

Na suspeita de encefalite viral, recomenda-se iniciar o tratamento empírico com aciclovir; a monitorização da função renal é necessária devido ao risco de nefropatia por cristais.

Nas encefalites por arbovírus, principalmente o Zika vírus, a tomografia computadoriza cerebral pode mostrar anormalidades específicas, como redução da atenuação dos lobos temporais ou áreas de hiperintensidade.