A finalidade básica da auditoria governamental é comprovar a legalidade e legitimidade dos atos e fatos administrativos e avaliar os resultados alcançados, quanto aos aspectos de eficiência, eficácia e economicidade da gestão orçamentária, financeira, patrimonial, operacional, contábil e finalística das unidades e das entidades da administração pública.

Não cabe ao controle interno apoiar o controle externo.

Os papéis de trabalho constituem um registro dos serviços executados pelo auditor, sobre os procedimentos que ele seguiu, os testes que efetuou, a informação que obteve e as conclusões relativas ao seu exame.

Pode-se afirmar que uma das missões básicas da auditoria interna é assessorar a administração, no desempenho de suas funções e responsabilidades, através do exame da adequação e eficácia dos controles, integridade e confiabilidade das informações e registros para assegurar a observância de políticas, metas, planos, procedimentos, leis, normas e regulamentos e sua efetiva utilização.

De acordo com a Constituição Federal, os Poderes Legislativo, Executivo e Judiciário manterão, de forma integrada, um sistema de controle interno.