A contaminação com material genético pode ser removida fisica e enzimaticamente.

Caso os procedimentos necessários para evitar contaminação não sejam seguidos corretamente, qualquer DNA contaminante pode ser amplificado no lugar do molde desejado.

As ponteiras com filtro e a centrifugação dos tubos, antes de abri-los, impedem a formação de aerossóis e reduzem a possibilidade de troca de material genético entre as pipetas.

O material amplificado pela técnica de PCR é uma das causas de contaminação de um laboratório de Biologia Molecular, portanto é necessário que as salas de extração de DNA e amplificação do material genético sejam distantes entre si.

Antes e depois de iniciar um procedimento experimental de amplificação do material genético pela Reação em Cadeia da Polimerase (PCR), limpe toda a área de trabalho com álcool absoluto para eliminar microrganismos e degradar ácidos nucléicos íntegros ou amplificados.