Após a ingestão de qualquer material que deixe resíduo cristalino, como compostos antidiarreicos não absorvíveis e antiácidos ou bismuto, a amostra de fezes somente poderá ser coletada, para análise, após uma semana.

O uso de meios de contraste radiológicos não altera o número de protozoários.

Amostras de fezes líquidas, sem conservantes, devem ser examinadas em até uma hora após a coleta para a pesquisa de trofozoítos.

O exame de três amostras coletadas em dias alternados não apresenta vantagem para o diagnóstico de Giardia lamblia e Strongyloides stercoralis, uma vez que ambos liberam formas de maneira contínua nas fezes.