Dois problemas tendem a encurtar a vida de uma coluna analítica. Primeiro, solutos que se ligam irreversivelmente à fase estacionária podem degradar o desempenho da coluna e diminuir a fase estacionária disponível. Segundo, materiais particulados injetados com a amostra podem entupir a coluna analítica. Para minimizar esses problemas, pode-se usar uma pré-coluna (guard column), posicionada antes da coluna analítica. Normalmente, essas pré-colunas contêm o mesmo material particulado empacotado e a mesma fase estacionária da coluna analítica, mas são significativamente menores e mais baratas.