Durante o processo de fosforilação oxidadativa, moléculas de NADPH são bombeadas da matriz mitocondrial para o espaço intramembranar.

Embora a mitocôndria possua DNA, a transcrição deste em RNA, que depende da maquinaria de transcrição basal, ocorre fora da mitocôndria.

Os ácidos graxos, que são parte integrante da membrana mitocondrial, podem ser sintetizados na própria mitocôndria.

Tanto a frutose quanto a glicose são captadas pela mitocôndria e podem ser diretamente utilizadas pelas enzimas metabólicas ali presentes para gerar energia na forma de ATP.

Durante o processo de fosforilação oxidativa, prótons são bombeados da matriz mitocondrial para o espaço intramembranar.