a molécula do HLA-B27, codificada por um alelo da região HLA-B classe II do complexo maior de histocompatibilidade, apresenta antígenos artritogênicos aos receptores dos linfócitos T CD4+, desencadeando o processo inflamatório autoimune.

a interleucina-17 tem sido considerada um mediador crítico na patogênese, entretanto estudos com anticorpos monoclonais anti-IL17 não têm demonstrado bons resultados clínicos.

inflamação crônica do trato respiratório é um fator de risco bem estabelecido para o desencadeamento do processo inflamatório axial, apesar de ainda ser controverso o papel de determinados microrganismos como gatilhos ambientais.

o HLA-B27 apresenta cerca de 100 subtipos, sendo que os subtipos B*2704 e B*2705 não estão associados a maior risco de desenvolver a doença.