A anfotericina B é insolúvel em água, mas foi formulada para infusão IV através de um complexo com o sal biliar desoxicolato. O complexo é comercializado em forma de pó liofilizado, que contém 50 mg de anfotericina B, 41 mg de desoxicolato e uma pequena quantidade de tampão de fosfato de sódio. O complexo forma um coloide na água, com partículas cujo diâmetro é, em grande parte, inferior a 0,4 μm.
O uso de filtros no equipo de infusão IV, para filtrar as partículas com mais de 0,22 μm,