Também conhecido como carcinoma de células escamosas, da margem e do canal anal, é menos incidente em heterossexuais masculinos portadores do HIV que na população em geral.

A associação à infecção pelo papilomavírus (HPV), a sexo anal passivo, inflamações crônicas não-infecciosas e tabagismo é descrita como de risco para o CEC perianal nos doentes portadores do HIV.

Nota-se a existência de alguns fatores de risco para o aparecimento do câncer: imunodepressão provocada pelo HIV, presença dos linfócitos T CD4+ abaixo de 100/mm³ , carga viral de HIV indetectável, que sugere tratamento ineficaz ou ausente e denota imunodepressão iminente, e presença de displasias.