Vírus são agentes patogênicos microscópicos, que necessitam parasitar o interior da célula para poder se reproduzir. Na piscicultura, as doenças infecciosas de origem virótica apresentam dificuldade de controle, portanto, a prevenção é a forma mais adequada de combatê-las.

Protozoários são organismos unicelulares de vida livre, comensais ou parasitas. A maioria dos protozoários tem ciclo vital direto, apresentando formas de resistência, o que torna seu controle mais complicado. Como a diagnose de protozoários é mais complexa do que a de bactérias, fungos e vírus, o conhecimento sobre os grupos que infestam os cultivas no Brasil é menor.

Fungos são organismos multicelulares e saprófitas. Poucas espécies de fungos são efetivamente parasitas de peixes. São considerados agentes infecciosos secundários e, como exemplo, tem-se as espécies de Saprolegnia.

As bactérias são organismos unicelulares e microscópicos, e, na piscicultura, elas representam o principal grupo de organismos patogênicos, incluem-se as Aeromonas hydrophila. Micrococcus spp., Staphylococcus sp., Sallmonella spp., mais comumente reportadas no Brasil dentre outras.