Alguns microorganismos, como as bactérias que basificam o leite, são utilizados na fabricação de manteigas de creme ácido, queijos, leites fermentados, entre outros. Logo, são empregados como culturas especiais.

A contaminação do leite por cocos ocorre apenas após sua extração e pode produzir fenômenos de decomposição quando em percentual alto. Alguns desses fenômenos causam fermentação, outros causam sabor putrefato, amargo e/ou saponáceo.

O leite possui escassa quantidade de germes imediatamente depois de sua extração do úbere, mas a quantidade pode ser considerável se a vaca estiver enferma. Além disso, a mão do ordenhador pode ter até 45 milhões de germes.

A qualidade do leite é tanto pior quanto menor for a quantidade de agentes patológicos, tais como Streptococus ssp, Mycobacterium tubercusosis, bactérias do tifo e disenteria, vírus de febre aftosa, identificados no leite.

As propriedades do leite são alteradas por composição físico-químicas, agentes nutritivos, biocatalizadores, agentes microbianos e patógenos, presença ou ausência de toxinas, pus, produtos químicos e, embora em menor incidência, por antibióticos usados em tratamentos dos animais.