As principais atividades e ações que oferecem risco potencial ou efetivo ao meio ambiente, decorrentes da utilização e operação de embarcações são: carga e descarga; limpeza de compartimentos como praça de máquinas, conveses, portões e principalmente tanques de carga; colocação e retirada de água de lastro; transporte de produtos perigosos e a navegação ou trânsito da via.
Além dessas preocupações gerenciais na operação de embarcações, impactos provenientes de resíduos gerados durante todas as operações, que provocam contaminação das águas, do solo e do ar, alterações na fauna e na flora e o surgimento de doenças na comunidade local, os impactos mais gerais são:
