A focalização isoelétrica avalia o ponto isoelétrico de uma proteína em determinado gradiente de pH, em que a proteína terá carga líquida negativa.

A eletroforese em duas dimensões separa proteínas de massa molecular idênticamos, que diferem em seu ponto isoelétrico (pI), ou proteínas com pI semelhantes, mas com massas moleculares diferentes.

A razão da mobilidade eletroforética de uma molécula μ é a razão entre a sua velocidade V e seu potencial elétrico.

Os proteomas celulares podem ser visualizados por eletroforese bidimensional em gel e identificados com o auxílio de espectrometria de massas.